59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1646 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 403 aa  795    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 410 aa  219  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  35.34 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 407 aa  192  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  34.56 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 524 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  32.07 
 
 		 399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  36.64 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  35.24 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.26 
 
 		 401 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  33.89 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  38.31 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  39.3 
 
 		 491 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 402 aa  134  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 407 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  27.05 
 
 		 470 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  36.03 
 
 		 535 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 401 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 409 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  32.32 
 
 		 445 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  34.62 
 
 		 562 aa  113  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  31.31 
 
 		 401 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 402 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  33.73 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  29.82 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  29.1 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 403 aa  92.4  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 403 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  31.68 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 401 aa  90.9  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 403 aa  87.4  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.63 
 
 		 406 aa  86.7  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  28.68 
 
 		 397 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  29.57 
 
 		 401 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 404 aa  84  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 377 aa  82.8  0.000000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  30.23 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  28.16 
 
 		 397 aa  72.8  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0556  transcriptional regulator, XRE family  26.18 
 
 		 409 aa  69.3  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4555  hypothetical protein  33.11 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.922053  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  28.4 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  27.65 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  28.24 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  25.73 
 
 		 397 aa  56.6  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 184 aa  44.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  24.38 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0340  tetratricopeptide domain-containing protein  26.99 
 
 		 418 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.469664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0877  anaerobic benzoate catabolism transcriptional regulator  40.3 
 
 		 317 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.54694  normal  0.67724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3344  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 125 aa  43.1  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3929  hypothetical protein  38.81 
 
 		 483 aa  43.1  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2484  transcriptional regulator, XRE family  37.29 
 
 		 67 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>