69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0039 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 377 aa  756    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 407 aa  113  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  29.1 
 
 		 407 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  29.01 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  31.47 
 
 		 403 aa  86.3  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  29.73 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  27.57 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  29.67 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  26.01 
 
 		 410 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  29.25 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.15 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 403 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  31.3 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 403 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 411 aa  53.9  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  24.26 
 
 		 401 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  32.84 
 
 		 470 aa  52.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.38 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3450  transcriptional regulator protein-like protein  38.89 
 
 		 489 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168406  normal  0.18413 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0072  transcriptional regulator, XRE family  40.24 
 
 		 488 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0809805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  25.53 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06770  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 489 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.949032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1396  transcriptional regulator, XRE family  44.26 
 
 		 96 aa  50.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 416 aa  50.1  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  47.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 188 aa  47  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 394 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 176 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  37.93 
 
 		 342 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2489  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 478 aa  46.6  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  39.06 
 
 		 72 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2513  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 152 aa  46.2  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00277307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2170  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.22299  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2414  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1430  transcriptional regulator, XRE family  36.99 
 
 		 490 aa  45.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.236575  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2250  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2432  DNA-binding protein  35.14 
 
 		 186 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 220 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 406 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  40.62 
 
 		 91 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  26.36 
 
 		 408 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2004  MerR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00158357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  36.92 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0581  hypothetical protein  36.84 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0222358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  36.89 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_002978  WD0623  transcriptional regulator, putative  39.06 
 
 		 302 aa  44.7  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0864444  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 91 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  26.9 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  32.1 
 
 		 227 aa  43.9  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 107 aa  43.9  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 107 aa  43.9  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  39.19 
 
 		 145 aa  43.5  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 252 aa  43.5  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 108 aa  43.5  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.1 
 
 		 72 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 227 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  39.68 
 
 		 227 aa  43.1  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 401 aa  43.1  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8701  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 200 aa  42.7  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  24.37 
 
 		 414 aa  42.7  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 107 aa  42.7  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  30.77 
 
 		 107 aa  42.7  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>