84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3045 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 406 aa  809    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  35.74 
 
 		 337 aa  153  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 403 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 403 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  31.93 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 524 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  34 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  24.74 
 
 		 410 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  28.5 
 
 		 411 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  28.47 
 
 		 407 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  28.62 
 
 		 407 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  30.54 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  28.37 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  25.32 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  25.07 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  28.11 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  29.32 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  46.3 
 
 		 264 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 404 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.49 
 
 		 406 aa  53.5  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  27.55 
 
 		 407 aa  53.1  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  26.95 
 
 		 562 aa  51.6  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4554  transcriptional regulator, XRE family  29.08 
 
 		 408 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  28.29 
 
 		 527 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  25.06 
 
 		 400 aa  50.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  27.83 
 
 		 414 aa  50.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  46.94 
 
 		 103 aa  49.3  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 137 aa  48.9  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0301  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 167 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 402 aa  48.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  41.38 
 
 		 226 aa  47.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 227 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0122  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 91 aa  47.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.347741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 134 aa  47.4  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 219 aa  47.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  32.18 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1725  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 145 aa  47  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3328  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 77 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  47  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 219 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1554  XRE family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 91 aa  46.6  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.902215  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 231 aa  46.6  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  29.89 
 
 		 255 aa  46.6  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 217 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  35.16 
 
 		 191 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 401 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  46.67 
 
 		 215 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0591  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 113 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0039  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 411 aa  45.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16550  predicted transcriptional regulator  40.98 
 
 		 204 aa  44.3  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.45133 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  45.28 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0931  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 191 aa  44.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0364  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.854921  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0450  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.40319  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0197  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.846925  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1820  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1410  DNA-binding protein  42.62 
 
 		 94 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  28.96 
 
 		 535 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 179 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0927  XRE family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 155 aa  44.3  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0199009  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3877  helix-turn-helix domain protein  41.51 
 
 		 383 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.862285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2262  helix-turn-helix domain-containing protein  32 
 
 		 293 aa  43.9  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.827528  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 168 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  45.9 
 
 		 108 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 231 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 158 aa  43.5  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 191 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0894  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 83 aa  43.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0403499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  48.84 
 
 		 156 aa  43.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 180 aa  43.1  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 191 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 191 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 191 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 806 aa  43.1  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  45.1 
 
 		 97 aa  43.1  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1907  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 94 aa  43.1  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>