50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0574 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0574  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0615681  hitchhiker  0.00000129991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3814  transcriptional regulator, XRE family  34.56 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2738  XRE family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1289  XRE family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 136 aa  67.4  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.279078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2845  hypothetical protein  56.25 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1414  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1448  XRE family transcriptional regulator  61.11 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1014  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.145857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3721  transciptional regulator  58.82 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1641  DNA-binding protein  31.09 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03758  transcriptional regulator, XRE family  53.12 
 
 		 137 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4021  transcriptional regulator, XRE family  60 
 
 		 156 aa  62  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008763  Pnap_4993  hypothetical protein  57.45 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.639508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2103  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3743  XRE family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0174083  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2138  XRE family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1186  transciptional regulator  47.37 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000178331  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1386  XRE family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1588  XRE family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0186285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5034  XRE family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 231 aa  53.5  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2176  hypothetical protein  37.5 
 
 		 198 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0476608  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  47.06 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3919  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 104 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 406 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2711  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 112 aa  45.1  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.256888  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7511  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 283 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1574  XRE family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 737 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3341  transcriptional regulator, XRE family  40.58 
 
 		 217 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2305  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0843666 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2821  XRE family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0738374  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0002  type II restriction-modification system activator, putative  42.86 
 
 		 75 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0641  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 806 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0332  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 201 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.865127  normal  0.108372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2467  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 109 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06322  hypothetical protein  30.68 
 
 		 115 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2434  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 77 aa  41.6  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1368  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000513137  normal  0.127219 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3563  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 189 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0319  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000379854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3700  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 191 aa  40.8  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000696836  normal  0.275941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 77 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0936  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 84 aa  40.8  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000155637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 130 aa  40.8  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2734  XRE family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 178 aa  40.4  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00297691  normal  0.0817302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3637  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 757 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1454  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 189 aa  40.4  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>