More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2176 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2176  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 97 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3100  transcriptional regulator, XRE family  97.94 
 
 		 97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000473627  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3725  DNA-binding protein  44.64 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  42.25 
 
 		 182 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2054  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 186 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.388224 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  43.4 
 
 		 233 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  49.02 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  43.4 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  43.4 
 
 		 233 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  43.4 
 
 		 233 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 187 aa  50.8  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  40.68 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3484  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 200 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4384  transcriptional regulator, XRE family  37.68 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0791  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 528 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3184  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 190 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 359 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2487  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  34.38 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0898  XRE family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 179 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  38.98 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  46 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 184 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2231  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 187 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245077 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3418  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.961393 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  42.86 
 
 		 182 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1957  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 208 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.210401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 178 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2461  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000100603  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  35.06 
 
 		 93 aa  47.8  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0427  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 66 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.423701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  33.33 
 
 		 263 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0455  XRE family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 214 aa  47.4  0.00007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000298649 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2195  XRE family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1401  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2775  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.31723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  39.71 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4400  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0917  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2524  transcriptional regulator, XRE family  40.38 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000972778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4617  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1786  helix-turn-helix transcriptional regulator  40.98 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4740  DNA-binding protein  32.47 
 
 		 190 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  32.43 
 
 		 192 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 178 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0729  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4967  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454469  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 178 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4938  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.839761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4983  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 		 209 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0953387  normal  0.300371 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3034  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.123448  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4608  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.138106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0764  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4631  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4325  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.735671  normal  0.293625 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4437  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0661  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01840  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0605  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.769041  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4240  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0606  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.393584  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4252  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4613  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0695  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 260 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 513 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4633  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  44.9 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4256  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.949593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0610  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.081465  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  41.18 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4333  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  54.76 
 
 		 202 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4285  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 179 aa  45.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0750  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000884285 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4371  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0823  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0103184  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0850  XRE family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.406298  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  41.18 
 
 		 229 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0622  DNA-binding protein  38.71 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.475485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>