53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6329 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8757  putative transcriptional regulator, XRE family  81.33 
 
 		 414 aa  664    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 407 aa  813    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  47.8 
 
 		 401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1330  XRE family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 404 aa  190  4e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0338  helix-turn-helix domain protein  37.32 
 
 		 397 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0194  transcriptional regulator, XRE family  35.84 
 
 		 401 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0337  transcriptional regulator, XRE family  36.82 
 
 		 399 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4820  hypothetical protein  34.91 
 
 		 399 aa  146  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.906768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8549  transcriptional regulator, XRE family  29.56 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0123157  hitchhiker  0.000343252 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 411 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3359  helix-turn-helix domain-containing protein  32.72 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1646  transcriptional regulator, XRE family  33.58 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.24387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3599  XRE family transcriptional regulator  33.42 
 
 		 407 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.34153  hitchhiker  0.000152397 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30330  predicted transcriptional regulator  30.1 
 
 		 411 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.502087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2778  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  29.1 
 
 		 401 aa  120  6e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4372  transcriptional regulator, XRE family  31.56 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2462  XRE family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 524 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4570  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0669  transcriptional regulator, XRE family  29.24 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1521  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.965018 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2078  hypothetical protein  32.14 
 
 		 350 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0683232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1756  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 409 aa  90.1  6e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4908  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 402 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00382252 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  27.9 
 
 		 382 aa  84.3  0.000000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3695  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3746  XRE family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 397 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0840  helix-turn-helix domain-containing protein  28.76 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.557676  normal  0.0541802 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5282  hypothetical protein  29.82 
 
 		 470 aa  79.3  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2579  hypothetical protein  29.49 
 
 		 562 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8589  transcriptional regulator, XRE family  27.25 
 
 		 402 aa  77  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00719609  normal  0.402307 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4158  XRE family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 403 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0178123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4132  XRE family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6139  putative transcriptional regulator, XRE family  27.54 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0010  XRE family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141867  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1530  XRE family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0255908 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2850  hypothetical protein  29.08 
 
 		 445 aa  67.4  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.431926  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3690  XRE family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.456142 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0299  hypothetical protein  26.72 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.206461  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1360  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  25.55 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  30.58 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  26.11 
 
 		 403 aa  56.2  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3045  XRE family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.181635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4245  transcriptional regulator, XRE family  26 
 
 		 397 aa  50.8  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0133  helix-turn-helix domain protein  26.64 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3801  hypothetical protein  26.86 
 
 		 397 aa  49.3  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03080  hypothetical protein  30.52 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1131  hypothetical protein  29.8 
 
 		 491 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 113 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0783  XRE family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.500633  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  55 
 
 		 80 aa  43.5  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 173 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2853  helix-turn-helix domain protein  30.17 
 
 		 355 aa  43.1  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0204  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 82 aa  42.7  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>