53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2818 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 173 aa  352  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  94.22 
 
 		 173 aa  317  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  37.11 
 
 		 102 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4302  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 79 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.397769  normal  0.707115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 101 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 112 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2143  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 82 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1414  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0298473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1274  transcriptional regulator, XRE family  32.39 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  37.7 
 
 		 94 aa  45.1  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 68 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  35 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  35 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  35 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 104 aa  43.5  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 407 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 123 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 497 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 263 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3309  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 80 aa  42.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0952  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 185 aa  42  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0264927 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 89 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2712  transcriptional regulator, XRE family  31.43 
 
 		 134 aa  42.4  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00780  transposase  42.62 
 
 		 402 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 114 aa  42  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 105 aa  41.6  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 91 aa  42  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 91 aa  42  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 110 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 88 aa  41.6  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  38.27 
 
 		 127 aa  41.6  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1155  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 76 aa  41.2  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 110 aa  41.2  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  33.82 
 
 		 80 aa  41.2  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  37.25 
 
 		 90 aa  41.2  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 		 124 aa  41.2  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0914  XRE family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 108 aa  40.8  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  33.78 
 
 		 106 aa  40.8  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  46.3 
 
 		 145 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  43.59 
 
 		 503 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 142 aa  40.8  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 117 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1407  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 113 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000410599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1627  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 300 aa  40.8  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000332957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>