73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0627 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 101 aa  196  7.999999999999999e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  53.33 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  44.93 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  51.56 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  51.56 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  58.18 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 109 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  38.89 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  39.58 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  52.46 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  40.45 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  35.44 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  38.81 
 
 		 173 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  45.45 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  35.23 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  35.23 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 173 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  37.18 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  37.88 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  38.96 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 85 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  41.27 
 
 		 263 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  34.09 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  60 
 
 		 293 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4071  XRE family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3207  Fis family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 137 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  30.49 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2846  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 		 443 aa  43.5  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.675443  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0049  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  43.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2259  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208232 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0903  helix-turn-helix domain-containing protein  47.73 
 
 		 255 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000193278  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3452  XRE family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663331  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 176 aa  41.6  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  37.25 
 
 		 85 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  42.59 
 
 		 124 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1505  XRE family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 87 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.139126  normal  0.0361039 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4415  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 213 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  41.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 118 aa  41.6  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000679525  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  44.23 
 
 		 256 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  37.93 
 
 		 143 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  35 
 
 		 264 aa  41.2  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3648  transcriptional regulator, XRE family  51.43 
 
 		 283 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.783622  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 142 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  30.68 
 
 		 123 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0685  Cro/CI family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0647  transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.9067299999999995e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0633  putative phage repressor  38.18 
 
 		 209 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.681909  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 117 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2543  transcriptional regulator, XRE family  36.05 
 
 		 104 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0592097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 145 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 234 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>