76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_A1707 on replicon NC_009079
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA0719  DNA-binding protein  100 
 
 		 80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.196932  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0743  DNA-binding protein  100 
 
 		 80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1707  DNA-binding protein  100 
 
 		 80 aa  163  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1559  DNA-binding protein  98.75 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810667  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2441  DNA-binding protein  98.75 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1246  DNA-binding protein  98.75 
 
 		 80 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.578172  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4563  transcriptional regulator, XRE family  62.03 
 
 		 80 aa  107  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6264  XRE family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0000184029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3948  XRE family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697178 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0717  DNA-binding protein  40.54 
 
 		 80 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0622  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.54 
 
 		 80 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.831827  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0810  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 85 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.697679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2106  hypothetical protein  40.79 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  36.84 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4916  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.366268  normal  0.960861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3194  XRE family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1813  helix-turn-helix domain-containing protein  38.67 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.464134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3550  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0545283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  40.28 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3837  helix-turn-helix domain-containing protein  34.67 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 490 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  52 
 
 		 497 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03892  DNA-binding protein  43.06 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5654  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279432  normal  0.298954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1469  Cro/CI family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0800  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0902  transcriptional regulator, XRE family  29.73 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0903  transcriptional regulator, XRE family  35.82 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3342  putative transcriptional regulatory protein  42.11 
 
 		 87 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0179651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0041  XRE family transcriptional regulator  67.65 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0512908  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3691  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1022  transcriptional regulator, XRE family  43.55 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0459  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.995488  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5955  transcriptional regulator, XRE family  35 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2410  XRE family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000194776  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1907  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2577  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0918178  hitchhiker  0.000133769 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2611  XRE family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 135 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0796411  hitchhiker  0.0000000000000114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0794  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.382222 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1652  XRE family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000422118  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 264 aa  43.5  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3349  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3134  DNA-binding protein  42.31 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5935  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0264  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.45 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.269806  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4878  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1547  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 90 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0103504  normal  0.0779138 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2281  XRE family transcriptional regulator  51.22 
 
 		 74 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.048354  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7321  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000062062  decreased coverage  0.00000000166173 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  35.56 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3324  Cro/CI family transcriptional regulator  40 
 
 		 212 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  52.94 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3445  XRE family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 76 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1806  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.579392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4174  XRE family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.852413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0368  XRE family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1052  hypothetical protein  30 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2326  hypothetical protein  30 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2421  XRE family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 150 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3803  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0337  XRE family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0583349  normal  0.335191 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1887  XRE family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 104 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.603654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 477 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2488  hypothetical protein  39.22 
 
 		 467 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1170  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 196 aa  40  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0638  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 74 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000543981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0576  XRE family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 74 aa  40  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000016932  normal  0.922143 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>