253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0510 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 114 aa  231  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000759518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 137 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  47.62 
 
 		 321 aa  61.6  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  34.55 
 
 		 114 aa  61.6  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0239  XRE family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000283783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142648  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 115 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000152617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0117  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 118 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  44.62 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  33.64 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  42.86 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1543  XRE family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 359 aa  56.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  45.16 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  35 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000672654  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  42.62 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  40.98 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  46.03 
 
 		 301 aa  53.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  39.02 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 111 aa  52.8  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  33.33 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000010572  hitchhiker  0.0000267972 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  42.42 
 
 		 205 aa  52.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  41.94 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  37.68 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000119777  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  32.84 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  32.84 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2015  Cro/CI family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00850971  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 142 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 273 aa  50.4  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  42.11 
 
 		 328 aa  50.4  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  41.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  42.62 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  41.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4781  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00061071  normal  0.699893 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 268 aa  50.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  35.48 
 
 		 117 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4788  transcriptional regulator, XRE family  29.9 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000200631  normal  0.763075 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  41.94 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.5 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000142015  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1673  ABC transporter related  41.18 
 
 		 293 aa  49.3  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000539653  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1578  helix-turn-helix domain protein  43.55 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00571888  normal  0.126267 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3663  helix-turn-helix domain protein  43.55 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  41.67 
 
 		 347 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0058  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0711688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 262 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  34.18 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  38.6 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  39.06 
 
 		 459 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 252 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4028  prophage LambdaBa02, repressor protein  43.48 
 
 		 122 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210086  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 334 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  35.48 
 
 		 338 aa  47.8  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 71 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 370 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  34.72 
 
 		 227 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 183 aa  47.4  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  29.46 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4320  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.810122  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 117 aa  47  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0337  DNA-binding protein  41.67 
 
 		 135 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3286  DNA-binding protein  32.43 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.414425  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  44.07 
 
 		 436 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2965  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 224 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.598952  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0418  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.08 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00527482  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0450  transcriptional regulator, XRE family  38.71 
 
 		 268 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0432  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  43.08 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000371645  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1254  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2814  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 		 128 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1191  transcriptional regulator, XRE family  34.78 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000106363  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1378  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  37.1 
 
 		 481 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.84072  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 261 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000209596  hitchhiker  0.000000000000029 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2451  transcriptional regulator, XRE family  29.09 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000925763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>