176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1542 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1542  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  210  4.9999999999999996e-54  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2319  transcriptional regulator, XRE family  47.92 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  35.11 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 110 aa  66.2  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 68 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  37.11 
 
 		 173 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4224  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  40.85 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 89 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2877  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 207 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3620  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1124  XRE family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.969354  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1256  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 491 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1459  helix-turn-helix domain protein  35.09 
 
 		 182 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0889  putative transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3970  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4397  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.78876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0875  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000023095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5958  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1982  XRE family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.623481  normal  0.364753 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3808  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.57528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0678  transcriptional regulator, XRE family  30.88 
 
 		 188 aa  47.8  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  42.11 
 
 		 517 aa  47.4  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4276  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15000  predicted transcriptional regulator  35.09 
 
 		 184 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.904149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0662  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 259 aa  47  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  37.7 
 
 		 513 aa  47  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2329  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.632323  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  38.89 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0626  transcriptional regulator, putative  38.57 
 
 		 303 aa  46.2  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0882771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  52.94 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  52.94 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  35 
 
 		 94 aa  47  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  36.67 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0808  putative repressor protein  45.45 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01392  predicted DNA-binding transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2212  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1622  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00320147  normal  0.504339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2039  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000824446  hitchhiker  5.01479e-19 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4268  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 503 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0543  helix-turn-helix domain protein  35.19 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1517  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1613  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2225  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.639128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1740  DNA-binding protein  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000189008  hitchhiker  2.35786e-17 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01402  hypothetical protein  38.6 
 
 		 178 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  30.12 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  40.43 
 
 		 90 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1783  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0323  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000737434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4079  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3635  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.314503 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2922  transcriptional regulator, XRE family  32.31 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.562834  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03443  transcriptional regulator, HTH_3 family protein  40.98 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4589  transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 188 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0389  XRE family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 178 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.762812  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.74 
 
 		 507 aa  45.1  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0872  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 192 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.62802  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1816  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00473491  hitchhiker  0.000617218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1556  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1722  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 185 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.185673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1642  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 186 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.065261  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1719  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.499876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0929  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145461  normal  0.153472 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2651  transcriptional regulator, XRE family  35.09 
 
 		 112 aa  43.9  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 199 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.74 
 
 		 509 aa  43.9  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 180 aa  43.5  0.0009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1341  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.4555000000000005e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1381  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1178  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.826744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1159  transcriptional regulator  38 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1153  transcriptional regulator  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4029  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.131881 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0328  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 		 191 aa  42.7  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000353964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1271  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1737  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46710  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0037508  decreased coverage  0.000000167672 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4813  putative transcriptionl regulator HipB  33.33 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1315  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1419  DNA-binding protein  41.3 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3701  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0424  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 188 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4024  putative transcriptional regulator  35.94 
 
 		 195 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5660  XRE family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 490 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.176576  normal  0.652733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1167  XRE family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0284  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.214235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2731  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000000000989155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  37.74 
 
 		 508 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0921  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 260 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.746837  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2928  DNA-binding protein  38.78 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  35.85 
 
 		 516 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0321  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000250107  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0327  XRE family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000523898  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>