97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2042 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  100 
 
 
90 aa  179  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  55.56 
 
 
90 aa  114  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 
112 aa  73.6  0.0000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  43.02 
 
 
109 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  43.75 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  42.35 
 
 
104 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4157  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.555179  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.843876 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  40.79 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  39.77 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3276  hypothetical protein  38.04 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0827  XRE family transcriptional regulator  51.28 
 
 
116 aa  63.9  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.551431  normal  0.496549 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  42.22 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  40.7 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0723  transcriptional regulator, XRE family  45.05 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  unclonable  0.00000669172 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  55.36 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  31.03 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  38.37 
 
 
117 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 
93 aa  60.5  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0763  XRE family transcriptional regulator  41.54 
 
 
91 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  38.16 
 
 
103 aa  60.5  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5139  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
95 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1361  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  34.94 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  43.24 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  40.96 
 
 
98 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  33.33 
 
 
95 aa  58.2  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3411  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  33.33 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  35.8 
 
 
108 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 
108 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  42.31 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  40.54 
 
 
105 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  41.03 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  34.12 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  34.12 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  33.72 
 
 
108 aa  55.1  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  40.54 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0364  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000740846  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1442  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 
91 aa  52  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  29.07 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  28.89 
 
 
93 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1031  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 
89 aa  51.2  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000313321  normal  0.707924 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1879  DNA-binding protein  36.25 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0311  transcriptional regulator  36.25 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  30.95 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  35.23 
 
 
124 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2079  XRE family transcriptional regulator  48.94 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0185194  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
136 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  33.33 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  33.33 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  34.72 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  30.49 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  40.35 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2293  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 
184 aa  42.7  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.351634 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  48.15 
 
 
263 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0017  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4003  DNA-binding protein  29.87 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 
110 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4562  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00197637  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3588  DNA-binding protein  29.87 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3722  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0676164  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6072  putative transcriptional regulator Cro/CI family  33.33 
 
 
233 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.406393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  37.25 
 
 
173 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3647  transcriptional regulator, XRE family  48.78 
 
 
507 aa  41.2  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 
123 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0983  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 
80 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.525138  normal  0.0218109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  41.86 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2363  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0998  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
195 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  40.38 
 
 
507 aa  40.4  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1730  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 
184 aa  40.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0538  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 
202 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3339  transcriptional regulator, XRE family  36.21 
 
 
733 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2743  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
180 aa  40.4  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0889  transcriptional regulator, XRE family  28.95 
 
 
190 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000492608  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
104 aa  40.4  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3970  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
85 aa  40  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  26.67 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  39.22 
 
 
118 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1574  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 
184 aa  40  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.844747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>