79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1922 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 123 aa  248  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 109 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  45.95 
 
 		 110 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  46.91 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 109 aa  65.5  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  35.92 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  44.29 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  36.46 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 264 aa  49.7  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 264 aa  49.7  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  34 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  44.44 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  37.7 
 
 		 123 aa  47  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 103 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  38.33 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  31.43 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  44.07 
 
 		 108 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  46.43 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 737 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  33 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  32.56 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  33 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  38.46 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 122 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  37.1 
 
 		 263 aa  44.7  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  32.93 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2818  transcriptional regulator, XRE family  37.35 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  36.84 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  35.94 
 
 		 102 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3207  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  27.85 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  29.81 
 
 		 99 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 107 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  32.47 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  35.59 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3946  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.78 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  37.84 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0315  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0773865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  43.1 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  33.93 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0858  XRE family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 497 aa  40  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.359757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>