45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2214 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  207  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  70.41 
 
 		 123 aa  133  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  52.38 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  44.59 
 
 		 100 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  47.22 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  48.39 
 
 		 110 aa  64.3  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  52.63 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  47.46 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  50 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  43.24 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  37 
 
 		 131 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  49.12 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  48.98 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  42.03 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  50 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  49.15 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  45 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  45 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  47.46 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 264 aa  52.4  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.11 
 
 		 263 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 124 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  38.98 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  42.37 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  32.93 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  39.29 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 135 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 149 aa  41.6  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 109 aa  41.2  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  37.7 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2243  transcriptional regulator, XRE family  36.49 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>