73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7019 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  43.52 
 
 		 135 aa  89  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  45.79 
 
 		 110 aa  87.8  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  43.12 
 
 		 109 aa  83.2  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 104 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 104 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  43.42 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 109 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  40.4 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  38.53 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  41.76 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  35.78 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  47.83 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  47.46 
 
 		 103 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  34.31 
 
 		 103 aa  48.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  36.36 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  35.11 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 103 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  35.11 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  40.79 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  38.81 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  45.28 
 
 		 219 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  36.78 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  34.78 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  39.44 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6629  putative Phage-related transcriptional regulator  35.8 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.275503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1000  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 504 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 110 aa  43.9  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  40.35 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 219 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  45.28 
 
 		 737 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  32.98 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  32.18 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0584  transcriptional regulator  35.23 
 
 		 495 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  41.67 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1447  putative transcription regulator protein  44.07 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5447  XRE family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0712  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 504 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3316  transcriptional regulator, XRE family  44.83 
 
 		 60 aa  42  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000216063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  38.16 
 
 		 127 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 234 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 91 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 505 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  38.6 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 103 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1528  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 411 aa  40.8  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  35.8 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1864  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 490 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3281  transcriptional regulator, XRE family  32.95 
 
 		 173 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.871806 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 		 218 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 108 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>