73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0381 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0381  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 91 aa  183  6e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  84.44 
 
 		 91 aa  156  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  68.13 
 
 		 91 aa  128  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  67.03 
 
 		 91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1932  transcriptional regulator, XRE family  60.44 
 
 		 91 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  62.64 
 
 		 107 aa  118  3e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0590  transcriptional regulator, XRE family  52.75 
 
 		 97 aa  101  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0647  XRE family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 97 aa  98.6  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.459505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1386  XRE family transcriptional regulator  55.71 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2425  transcriptional regulator  50 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1858  XRE family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 100 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2042  putative cytochrome c  40.54 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  31.17 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  31.17 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 104 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0928  DNA polymerase III delta prime subunit  32.53 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3103  transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 503 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.597911  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  40.91 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 95 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0593  transcriptional regulator, XRE family  34.95 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0244812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  40.3 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4023  transcriptional regulator, XRE family  33.77 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  38.16 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  39.13 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17690  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.6 
 
 		 517 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.356525  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  35.06 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0834  XRE family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.259279 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3182  transcriptional regulator, XRE family  41.07 
 
 		 513 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0470208  hitchhiker  0.000000000985397 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2672  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  41.27 
 
 		 508 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0658  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3859  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0601  transcriptional regulator, XRE family  37.66 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3477  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 737 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552103  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2467  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 122 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000461389  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13300  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  38.6 
 
 		 509 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.801467  normal  0.209244 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0807  helix-turn-helix domain-containing protein  38.16 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3260  transcriptional regulator, XRE family  45.65 
 
 		 513 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0795644  normal  0.23679 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12438  transcriptional regulator, XRE family protein  32.32 
 
 		 99 aa  44.3  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0697698  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  40.98 
 
 		 263 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  28 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5916  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1361  EPSP synthase (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase)  39.34 
 
 		 516 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419571  normal  0.53858 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0529  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000109326  normal  0.171352 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3174  XRE family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00826056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1138  transcriptional regulator, XRE family  35.53 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.4972  normal  0.249316 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3863  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.71 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.640494  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15700  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  35.59 
 
 		 507 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.645755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 264 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1829  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2529  transcriptional regulator, XRE family  35.9 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000784971  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1916  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193475  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3256  helix-turn-helix domain-containing protein  29.41 
 
 		 136 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1888  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 136 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  32.95 
 
 		 94 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4271  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2419  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4410  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  41.27 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0985  transcriptional regulator, XRE family  36.54 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00196627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  44.44 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4900  hypothetical protein  36.54 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.978216  normal  0.040659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1817  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.252724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1927  XRE family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2220  DNA-binding protein  44.9 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0402427  normal  0.0285701 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3280  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.843876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>