35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3673 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  199  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  95.15 
 
 		 103 aa  190  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  93.2 
 
 		 103 aa  185  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  91.26 
 
 		 103 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  48.91 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  46.38 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  39.71 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  48.33 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  42.47 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  49.12 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  43.48 
 
 		 131 aa  50.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  43.28 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  42.25 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 109 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 264 aa  48.1  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  33 
 
 		 123 aa  46.2  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  35.23 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  40.32 
 
 		 118 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  39.06 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 263 aa  44.3  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  26.61 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 100 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  32.39 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  34.72 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 112 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>