53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2429 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_2429  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 103 aa  204  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3807  hypothetical protein  48.86 
 
 		 100 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8074  transcriptional regulator  50 
 
 		 95 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.725371  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0895  putative transcriptional regulator  45.26 
 
 		 110 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.652502  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0097  putative transcriptional regulator  44.57 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0986  helix-turn-helix domain protein  55 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.85534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0636  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5283  hypothetical protein  46.34 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.488524  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0024  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0010  DNA-binding protein  38.46 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.713803 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_009516  PsycPRwf_2396  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1380  transcription regulator  34.41 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  35.92 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2805  XRE family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2214  hypothetical protein  47.46 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.351958 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3798  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 123 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000456685  hitchhiker  0.000109219 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3673  helix-turn-helix domain-containing protein  48.44 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  36.56 
 
 		 100 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3687  helix-turn-helix domain protein  48.44 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  36.89 
 
 		 110 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3625  helix-turn-helix domain protein  48.44 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3535  XRE family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0665  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 100 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3835  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5523  helix-turn-helix domain-containing protein  43.06 
 
 		 118 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0720631  hitchhiker  0.0000000329462 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 263 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1457  putative transcriptional regulator, XRE family  35.48 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0521049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1480  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  45.28 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.695506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  43.94 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 109 aa  53.5  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5489  helix-turn-helix domain-containing protein  47.06 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.173303  normal  0.332694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  38.95 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  34.69 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2672  XRE family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.474837  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  34.38 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  44.74 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  46.43 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1909  XRE family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  35.16 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02632  helix-turn-helix domain protein  40 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2125  transcriptional regulator, XRE family  31.51 
 
 		 91 aa  40.8  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 91 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>