58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5820 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5820  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 104 aa  208  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.790408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0390  XRE family transcriptional regulator  88.46 
 
 		 104 aa  191  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2882  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00173461  normal  0.866875 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4468  hypothetical protein  63.38 
 
 		 125 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0174205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  40.37 
 
 		 109 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8306  transcriptional regulator, XRE family  46.46 
 
 		 107 aa  78.2  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.6083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7015  putative transcriptional regulator, XRE family  43.16 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00989255 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8556  putative transcriptional regulator, XRE family  55.71 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6666  helix-turn-helix domain protein  43.27 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.384306  normal  0.352226 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13205  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 109 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000994764  normal  0.452707 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1661  helix-turn-helix domain-containing protein  40.2 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.333034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1336  helix-turn-helix domain-containing protein  40.2 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1922  transcriptional regulator, XRE family  40.45 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189064  normal  0.0105553 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2395  putative transcriptional regulator, XRE family  34.26 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4345  transcriptional regulator, XRE family  40.4 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0197394  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12056  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0744  DNA-binding protein  42.17 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0627  transcriptional regulator, XRE family  41.57 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.845219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0010  DNA-binding protein  45.76 
 
 		 93 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.235299  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1165  toxin-antitoxin system, antitoxin component, Xre family  38.3 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000604987 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0791  transcriptional regulator, XRE family  45.61 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0039  DNA-binding protein  43.64 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.514774  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0650  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11984  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1336  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2564  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2735  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0099  DNA-binding protein  41.82 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 227 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0024  hypothetical protein  37.68 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000416515  hitchhiker  0.00176167 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1724  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5326  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.134062 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3853  XRE family molybdate metabolism transcriptional regulator  40.3 
 
 		 377 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.593506  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 219 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  39.62 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3540  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 94 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0282  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 94 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0074  hypothetical protein  38.1 
 
 		 94 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 219 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01487  phage N15 gp48-like protein  41.82 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.497667  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0346  transcriptional regulator of molybdate metabolism, XRE family  36.51 
 
 		 377 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01498  hypothetical protein  41.82 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.573871  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0117  putative DNA-binding protein  42.86 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.197061  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3207  Fis family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14454  normal  0.140358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0874  putative transcriptional regulator, XRE family  40.3 
 
 		 117 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0065  hypothetical protein  33.9 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 285 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0084  XRE family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 109 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1496  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 110 aa  40.4  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2787  transcriptional regulator, XRE family  41.51 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 217 aa  40.8  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1451  helix-turn-helix domain-containing protein  28.87 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2518  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.99787 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4582  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.752323 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4042  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.1 
 
 		 376 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805509  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1631  transcriptional regulator, XRE family  53.66 
 
 		 401 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.182309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0870  transcriptional regulator, XRE family  32.22 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>