More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2869 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 285 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4520  regulatory protein TetR  38.21 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  39.67 
 
 		 223 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 221 aa  105  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 202 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 212 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 214 aa  95.5  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 232 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 194 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 223 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30.16 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 206 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 235 aa  86.3  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 220 aa  85.9  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 196 aa  85.9  8e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 201 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 196 aa  81.6  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1833  regulatory protein, TetR  31.28 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30.18 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  24.48 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 200 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3566  regulatory protein TetR  29.65 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0836  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.177404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.12 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3999  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 215 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 219 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 770 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2063  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 204 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3602  transcriptional regulator, XRE family  47.14 
 
 		 488 aa  58.9  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 233 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2416  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3030  XRE family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 259 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0924  transcriptional regulator, XRE family  47.76 
 
 		 505 aa  57.4  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1033  transcriptional regulator, XRE family  43.37 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4794  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>