More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5283 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 215 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 205 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  87.88 
 
 		 205 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  81.96 
 
 		 200 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  79.14 
 
 		 197 aa  315  2e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  62.03 
 
 		 197 aa  243  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  54.73 
 
 		 204 aa  228  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  51.52 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  55.79 
 
 		 197 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  44.75 
 
 		 183 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  43.2 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  40.1 
 
 		 224 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 208 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  31.12 
 
 		 198 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  31.63 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 188 aa  92  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 207 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 211 aa  86.7  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 228 aa  84.7  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 200 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 196 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.44 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 235 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
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NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 482 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 482 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 200 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 217 aa  70.1  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  28.83 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 224 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4158  TetR family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 445 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.98 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 225 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
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NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
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