More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0108 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  89.81 
 
 		 224 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  91.58 
 
 		 209 aa  380  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 214 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 219 aa  89  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 195 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 211 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 200 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.96 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  22.71 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 240 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  29 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.23 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 228 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 770 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 260 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  25.52 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 211 aa  62  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 204 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 201 aa  61.2  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  26.46 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  22.17 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  24.87 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.1 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
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NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  24.88 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
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NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  26.37 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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