More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2438 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  81.64 
 
 		 214 aa  359  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 224 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 211 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 189 aa  105  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 196 aa  102  6e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 201 aa  95.9  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 188 aa  94  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 202 aa  92.8  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 202 aa  91.7  7e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 208 aa  91.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 200 aa  91.3  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 223 aa  89.7  3e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 217 aa  89.4  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 194 aa  89  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 228 aa  88.2  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  26.18 
 
 		 202 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 195 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 205 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 235 aa  81.3  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 231 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 219 aa  78.2  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.27 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  29.1 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 219 aa  72  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 214 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  24.87 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  20.99 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 219 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 215 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  26.01 
 
 		 198 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  24.86 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
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NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
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NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
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NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
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NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 251 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
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NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
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NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
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NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
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NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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