More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1471 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  54.38 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 233 aa  85.9  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 205 aa  85.5  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 202 aa  84.7  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 214 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 194 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 256 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 213 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.47 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 215 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 188 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 246 aa  75.5  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  33.73 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  26.42 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 228 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
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NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  23.9 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
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NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
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NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.55 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
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NC_013595  Sros_3420  putative transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.908094  normal  0.385629 
 
 
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NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
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NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
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NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 258 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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