More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A3212 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  84.73 
 
 
206 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  75.13 
 
 
204 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  72.28 
 
 
202 aa  309  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  73.27 
 
 
202 aa  309  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  70.5 
 
 
201 aa  307  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
201 aa  307  8e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
201 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 
201 aa  305  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  70.35 
 
 
199 aa  304  7e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  69.85 
 
 
199 aa  304  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  59.31 
 
 
207 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  59.31 
 
 
207 aa  244  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  59.02 
 
 
215 aa  240  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  45.54 
 
 
213 aa  166  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  41.62 
 
 
211 aa  159  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 
219 aa  158  7e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  41.04 
 
 
212 aa  155  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  43.78 
 
 
208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  42.29 
 
 
211 aa  145  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 
205 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
229 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 
227 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 
226 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 
260 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
199 aa  117  9e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
198 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
213 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
198 aa  112  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
199 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  23 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 
219 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 
189 aa  68.6  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  21.03 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  28.38 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 
238 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 
182 aa  65.9  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 
256 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
197 aa  63.5  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
183 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 
214 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 
222 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 
195 aa  60.8  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 
204 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 
204 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 
309 aa  59.3  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
209 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
215 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
211 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  23.27 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  22.28 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  25.26 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  24.47 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 
419 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  39.39 
 
 
220 aa  55.5  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 
225 aa  55.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
231 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 
214 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
240 aa  55.1  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
205 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 
225 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
208 aa  54.7  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>