More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0370 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  447  1e-125  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 217 aa  95.9  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 260 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 207 aa  91.7  8e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 770 aa  89.4  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 246 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 252 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 202 aa  85.1  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 238 aa  82  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  31.38 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 240 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.89 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 419 aa  78.6  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 437 aa  74.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 201 aa  72  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  25.27 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 422 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  28.96 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5475  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 232 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 241 aa  65.5  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2825  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 215 aa  65.1  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  28.21 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
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NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 219 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
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NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
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NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
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