More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10159 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  441  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  78.26 
 
 		 224 aa  341  5e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0098  TetR family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31231  normal  0.349087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0108  TetR family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0117  TetR family transcriptional regulator  74.3 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0523426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  77.61 
 
 		 209 aa  327  7e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 189 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 208 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 217 aa  85.9  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 207 aa  85.1  7e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 219 aa  84.7  9e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 212 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 238 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  27.94 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.96 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 214 aa  72  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  27.69 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.64 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 240 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  23.94 
 
 		 770 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 208 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  26.24 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.42 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 255 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 209 aa  62  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 424 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1684  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.828148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  27.18 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  27.38 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
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NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
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