More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0992 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  68.14 
 
 		 211 aa  276  1e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  65.7 
 
 		 219 aa  276  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 212 aa  260  8e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 211 aa  218  5e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  59.22 
 
 		 205 aa  217  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  48.31 
 
 		 213 aa  181  7e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 211 aa  161  7e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 207 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 201 aa  143  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  141  7e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 210 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  40.66 
 
 		 215 aa  138  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 199 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  38.58 
 
 		 202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 226 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 222 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 260 aa  116  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 198 aa  100  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.15 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 238 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.82 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 204 aa  63.2  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 217 aa  62  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.24 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  50.88 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48190  putative transcriptional regulator  39.24 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114913  normal  0.0538885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  31.18 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>