More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1372 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 210 aa  420  1e-117  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 219 aa  114  8.999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3368  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.823068  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0894  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 260 aa  108  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 210 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0289  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 202 aa  106  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 205 aa  106  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 199 aa  106  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3668  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 202 aa  101  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0040426  hitchhiker  0.0000000599644 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0226  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 201 aa  101  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312291  hitchhiker  0.00018932 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 226 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3423  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 201 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 198 aa  99.4  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2782  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.522237  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0324  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0304  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 201 aa  99.8  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.826155  hitchhiker  0.000375508 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0243  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 201 aa  98.2  7e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0252  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 201 aa  98.2  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323074 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2579  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0006  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0589242  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3103  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.454868  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 213 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 198 aa  97.8  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3117  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1978  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3531  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0013  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3842  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3781  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  38.12 
 
 		 208 aa  94  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3212  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  92.8  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 192 aa  92.4  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 195 aa  88.2  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3375  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  34.21 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 207 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 194 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 		 198 aa  68.9  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.08 
 
 		 220 aa  66.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.64 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2516  transcriptional regulator, TetR family  45.68 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 260 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 408 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2241  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7288  hitchhiker  0.000000000000408452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  31.65 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>