More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0122 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  71.74 
 
 		 193 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  70.65 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  50.81 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  51.9 
 
 		 197 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  49.41 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  52.1 
 
 		 195 aa  148  4e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 190 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  46.35 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 		 182 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 206 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  45.86 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  49.2 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 222 aa  135  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  54.09 
 
 		 195 aa  134  9e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  47.02 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  42.27 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  49.14 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  46.7 
 
 		 194 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 363 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 425 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 193 aa  95.5  4e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  41.55 
 
 		 215 aa  92.4  4e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 197 aa  89  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 400 aa  88.2  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  36.36 
 
 		 403 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  34.19 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 408 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 410 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 388 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 412 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 451 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 451 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 428 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 424 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 235 aa  58.9  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 406 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 246 aa  58.2  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  36.04 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  35.2 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23.91 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2577  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>