More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2155 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  387  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  70.83 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  54.01 
 
 		 196 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  58.79 
 
 		 194 aa  177  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  55.43 
 
 		 197 aa  177  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  67.07 
 
 		 195 aa  175  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 225 aa  167  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  48.95 
 
 		 195 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 207 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 207 aa  164  5e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  54.7 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  53.46 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  52.15 
 
 		 197 aa  159  3e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  54.14 
 
 		 193 aa  155  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 206 aa  153  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  52.1 
 
 		 204 aa  148  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 182 aa  148  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  48.09 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 206 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  44.37 
 
 		 215 aa  111  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 425 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  43.51 
 
 		 197 aa  101  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 309 aa  96.3  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 408 aa  94.4  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 400 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 410 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 210 aa  88.2  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 363 aa  88.6  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  35.03 
 
 		 403 aa  87.8  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 470 aa  82  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 451 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  32.5 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 428 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  41.8 
 
 		 241 aa  75.1  0.0000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 385 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 412 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 412 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 406 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 393 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 394 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 394 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 394 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 391 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2147  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576982  hitchhiker  0.00198138 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3756  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2007  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.382346 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1887  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.943502 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 388 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  38.95 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  40.51 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 183 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4041  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.449289  normal  0.0505107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 396 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  37.78 
 
 		 182 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2194  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.789913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>