More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2775 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  464  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  85.59 
 
 		 221 aa  384  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  62.89 
 
 		 206 aa  237  1e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 206 aa  224  8e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  57.87 
 
 		 222 aa  222  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 216 aa  211  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  55.84 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 215 aa  201  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  58.12 
 
 		 206 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 212 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 221 aa  196  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 212 aa  194  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  50.51 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 195 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 224 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 224 aa  180  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  58.52 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  52.71 
 
 		 214 aa  178  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 219 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  45.37 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  44.85 
 
 		 224 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 228 aa  171  5.999999999999999e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  41.4 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  37.74 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 248 aa  109  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.69 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  91.7  8e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 218 aa  91.7  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 231 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 202 aa  90.9  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 220 aa  89  5e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 215 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 211 aa  86.3  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 212 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 205 aa  85.5  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 209 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 205 aa  85.1  9e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 216 aa  85.1  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.58 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 204 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  26.76 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 224 aa  75.9  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.09 
 
 		 271 aa  75.5  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 215 aa  75.1  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 317 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 273 aa  73.2  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 260 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.37 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  37.76 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>