More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30260 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  100 
 
 		 400 aa  792    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 390 aa  254  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 396 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 424 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  35.2 
 
 		 403 aa  186  9e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  44.49 
 
 		 470 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  36.16 
 
 		 363 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 412 aa  176  6e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 410 aa  176  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 394 aa  169  7e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 394 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 385 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 425 aa  160  4e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 451 aa  156  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 451 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 428 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 225 aa  102  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 220 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  39.31 
 
 		 220 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.93 
 
 		 309 aa  97.8  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 197 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 207 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 207 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 207 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 206 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 190 aa  91.7  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 206 aa  92  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 195 aa  91.3  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 195 aa  90.5  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 197 aa  89  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 193 aa  89  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 215 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 222 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 204 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 193 aa  86.3  8e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 193 aa  86.3  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 196 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 194 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  34.34 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  33.11 
 
 		 215 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2587  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 434 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.308714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2548  TetR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2593  TetR family transcriptional regulator  24.92 
 
 		 482 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.58 
 
 		 219 aa  62  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 346 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  43.9 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2195  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 240 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  21.52 
 
 		 190 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  31.5 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  31.06 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  32.82 
 
 		 221 aa  57  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 198 aa  57  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  40.32 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 191 aa  57  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  23.85 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 210 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 207 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.03 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 236 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>