More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4505 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  100 
 
 		 390 aa  778    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 388 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  39.1 
 
 		 400 aa  260  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 470 aa  143  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 408 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 391 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 385 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 410 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 451 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 451 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 428 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 425 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 403 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 412 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 394 aa  96.3  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 195 aa  94.4  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  35.59 
 
 		 210 aa  92  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  38.31 
 
 		 197 aa  92  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 206 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 195 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 207 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 207 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 206 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 225 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 196 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 160 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 190 aa  71.2  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 182 aa  71.2  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 203 aa  68.9  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  61.22 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.69 
 
 		 237 aa  62  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 240 aa  61.2  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 223 aa  59.3  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.22 
 
 		 224 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1096  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 209 aa  57  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 182 aa  57  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 207 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3722  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 194 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 211 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  34.94 
 
 		 222 aa  55.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  35.37 
 
 		 200 aa  55.8  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 197 aa  55.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 291 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 221 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 215 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3154  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 		 214 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0193225  normal  0.108939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>