More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6414 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 199 aa  395  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  70.83 
 
 		 195 aa  261  4.999999999999999e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  66.47 
 
 		 190 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  61.75 
 
 		 194 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  55.49 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  64.88 
 
 		 195 aa  175  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  49.48 
 
 		 195 aa  172  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  51.69 
 
 		 197 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 207 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 207 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  53.04 
 
 		 196 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  49.68 
 
 		 160 aa  151  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  49.72 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  47.59 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  49.14 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  45.45 
 
 		 210 aa  132  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  49.65 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 193 aa  117  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  42.96 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 425 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 309 aa  98.2  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 197 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 400 aa  91.7  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 363 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 410 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 408 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  33.99 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 393 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  30.92 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 424 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 428 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3994  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.777734 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 451 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 412 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 412 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  62.71 
 
 		 183 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 280 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 396 aa  65.1  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 385 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  36.96 
 
 		 227 aa  62  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 202 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 497 aa  61.2  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  59.09 
 
 		 470 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  37.76 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  50 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>