More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1558 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  100 
 
 		 220 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  75.25 
 
 		 212 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  75.25 
 
 		 212 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 217 aa  315  5e-85  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  75.25 
 
 		 212 aa  315  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  76.26 
 
 		 197 aa  307  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 197 aa  301  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  63.5 
 
 		 330 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  62.87 
 
 		 218 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  63.37 
 
 		 220 aa  266  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  62.44 
 
 		 216 aa  260  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  62.07 
 
 		 226 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  62.44 
 
 		 221 aa  258  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 205 aa  256  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  60.59 
 
 		 227 aa  255  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  62.31 
 
 		 317 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  62.24 
 
 		 200 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  58.22 
 
 		 231 aa  246  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  61.69 
 
 		 215 aa  247  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  60.78 
 
 		 271 aa  246  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 245 aa  245  3e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  58.42 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  57.28 
 
 		 218 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  58.96 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  58.05 
 
 		 204 aa  234  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  59.3 
 
 		 207 aa  230  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  56.85 
 
 		 199 aa  218  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  56.57 
 
 		 205 aa  217  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  54.98 
 
 		 215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 228 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 223 aa  97.4  1e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  94.7  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  93.2  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 224 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 195 aa  88.2  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 275 aa  85.5  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 206 aa  85.1  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 238 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 216 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 209 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 194 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 248 aa  70.5  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  28.27 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  45.21 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  42.67 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  29.87 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 213 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  47.44 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 236 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 213 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>