222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3020 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
213 aa  434  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  41.41 
 
 
275 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  39.29 
 
 
256 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 
226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
215 aa  118  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 
234 aa  118  7.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 
235 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 
234 aa  114  7.999999999999999e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  35.53 
 
 
218 aa  112  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 
266 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 
253 aa  105  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  33.17 
 
 
251 aa  102  6e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  37.85 
 
 
211 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 
246 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 
253 aa  98.2  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 
211 aa  93.6  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  28.35 
 
 
246 aa  92.8  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
246 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
246 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
246 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 
238 aa  90.5  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 
200 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 
194 aa  88.2  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
197 aa  86.7  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.68 
 
 
246 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  31.67 
 
 
223 aa  84  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  32.98 
 
 
237 aa  82.4  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  28.57 
 
 
237 aa  74.7  0.0000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  30.98 
 
 
206 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
207 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  29.44 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.86 
 
 
226 aa  71.6  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
224 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
224 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.37 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
212 aa  67  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
271 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
225 aa  66.6  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 
206 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
199 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 
221 aa  62.4  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 
209 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
216 aa  61.6  0.000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
330 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 
231 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
215 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 
201 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 
220 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 
205 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 
220 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
218 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 
317 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.54 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>