More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  100 
 
 		 256 aa  524  1e-148  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  60.55 
 
 		 275 aa  279  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 215 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1827  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1874  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0418563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1808  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 246 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4290  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.362272  normal  0.446856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0771  regulatory protein TetR  33.96 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 234 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 211 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1683  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 197 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.947535  normal  0.202583 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4602  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.904797 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  32.51 
 
 		 226 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  31.25 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  34.44 
 
 		 212 aa  99  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.95 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 271 aa  97.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21260  transcriptional regulator, tetR family  29.83 
 
 		 251 aa  96.3  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.646658  normal  0.296128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 238 aa  95.9  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 224 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 204 aa  92.8  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 206 aa  91.7  9e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 207 aa  91.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.09 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 224 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  90.1  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 200 aa  89.7  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  31.89 
 
 		 206 aa  89.4  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 206 aa  89  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2143  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 249 aa  88.6  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.101921  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.68 
 
 		 226 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 216 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 221 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23490  transcriptional regulator, tetR family  31.67 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.411786  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 231 aa  86.7  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 227 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2377  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 211 aa  86.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.081674 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 217 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1890  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 253 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00021201 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 199 aa  84.7  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 219 aa  84.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 225 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  78.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11710  transcriptional regulator, tetR family  29.95 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 216 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1198  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.71 
 
 		 213 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>