More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3157 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 330 aa  644    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  68.34 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  74.15 
 
 		 216 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  72.22 
 
 		 218 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  73.74 
 
 		 271 aa  296  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  71.43 
 
 		 221 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  66.83 
 
 		 211 aa  283  3.0000000000000004e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  68.75 
 
 		 200 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  66 
 
 		 227 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  66.84 
 
 		 245 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  66.03 
 
 		 225 aa  275  7e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  63.43 
 
 		 231 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  65.5 
 
 		 226 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  64.97 
 
 		 215 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  65.83 
 
 		 218 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  63.5 
 
 		 220 aa  269  5.9999999999999995e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  65.99 
 
 		 205 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  61.93 
 
 		 217 aa  262  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 197 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 212 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 212 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 212 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  64.77 
 
 		 205 aa  254  1.0000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  61.46 
 
 		 197 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  60.1 
 
 		 204 aa  245  8e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  59.5 
 
 		 207 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  56.87 
 
 		 215 aa  242  5e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  53.21 
 
 		 220 aa  241  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  58.55 
 
 		 199 aa  236  6e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31 
 
 		 237 aa  92.8  7e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.97 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 223 aa  85.1  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 224 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 275 aa  81.6  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 215 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 222 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 201 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  50.77 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 204 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 197 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 220 aa  68.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 219 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  28.71 
 
 		 202 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 206 aa  68.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 200 aa  67  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 233 aa  65.9  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 206 aa  65.1  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  42.35 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0929  TetR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 199 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  46.43 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  28.76 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  45 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>