More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8610 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 317 aa  629  1e-179  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  71.64 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  76.38 
 
 		 218 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  75.26 
 
 		 221 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 		 216 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  73.33 
 
 		 271 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  69.59 
 
 		 200 aa  282  6.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  65.09 
 
 		 225 aa  275  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  67.34 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  62.62 
 
 		 245 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  65.46 
 
 		 227 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  62.21 
 
 		 231 aa  268  8e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  65.98 
 
 		 226 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  66.49 
 
 		 205 aa  265  8e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 218 aa  265  8.999999999999999e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  62.31 
 
 		 220 aa  263  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 197 aa  263  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  65.48 
 
 		 205 aa  262  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 197 aa  261  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  63.4 
 
 		 215 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 217 aa  260  3e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 212 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 212 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 212 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  58.5 
 
 		 215 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  58.03 
 
 		 207 aa  229  5e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 220 aa  228  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 204 aa  227  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  54.59 
 
 		 273 aa  222  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  54.87 
 
 		 199 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 228 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 223 aa  89  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  88.6  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.62 
 
 		 237 aa  87.8  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  32.8 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 211 aa  76.3  0.0000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 206 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 216 aa  72.4  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 216 aa  70.5  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 220 aa  65.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 216 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1383  putative transcriptional regulatory protein  30.41 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 254 aa  61.2  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 202 aa  58.9  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 213 aa  58.9  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  29.27 
 
 		 202 aa  58.5  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 209 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 194 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>