More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1496 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  410  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 218 aa  108  6e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 224 aa  105  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  35.32 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 224 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.84 
 
 		 237 aa  89  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 224 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 207 aa  88.6  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 212 aa  87.8  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  32.35 
 
 		 202 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  86.3  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  30.5 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  38.13 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  36.97 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  39.8 
 
 		 221 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 330 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.8 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  54.72 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 197 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 223 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 271 aa  65.1  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  48.53 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0594  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0201579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4569  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000245113  hitchhiker  0.00602594 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0634  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000435144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0639  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.307578  hitchhiker  0.000146714 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8152  putative transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.687421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  45.59 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  47.14 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3699  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 220 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>