More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4588 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  67.33 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  67.16 
 
 		 212 aa  275  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  61.86 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 206 aa  245  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  60.7 
 
 		 221 aa  245  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  59.39 
 
 		 222 aa  241  6e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  60.5 
 
 		 214 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  58.46 
 
 		 216 aa  236  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 215 aa  235  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  60.51 
 
 		 206 aa  234  6e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  60.82 
 
 		 216 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 195 aa  223  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  50.25 
 
 		 237 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  51.01 
 
 		 223 aa  208  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  53.61 
 
 		 221 aa  204  5e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 212 aa  202  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 224 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 224 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  50.51 
 
 		 228 aa  191  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  42.93 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  37.85 
 
 		 254 aa  123  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 197 aa  105  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 197 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  31.37 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 211 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 205 aa  99.4  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 220 aa  97.4  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 211 aa  96.3  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  33.16 
 
 		 226 aa  94.7  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 216 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 205 aa  88.2  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4029  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 217 aa  85.9  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.697639  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 211 aa  85.5  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 271 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 200 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 209 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 231 aa  81.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 273 aa  78.6  0.00000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 317 aa  78.2  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  29.56 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.86 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  26.8 
 
 		 202 aa  74.7  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 275 aa  74.7  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0805  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  29.84 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10480  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0103  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0757  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106421  normal  0.698078 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>