More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0138 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  89.4 
 
 		 224 aa  397  9.999999999999999e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 220 aa  205  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  51.24 
 
 		 209 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  48.8 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  45.79 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 204 aa  156  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 209 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  42.78 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  41.01 
 
 		 225 aa  124  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 206 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.17 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 211 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 207 aa  98.6  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 206 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 224 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 203 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 215 aa  89.4  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 238 aa  89  5e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  36.64 
 
 		 228 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 271 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  35.24 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 204 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  29.02 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  29.23 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 330 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 215 aa  74.7  0.0000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 205 aa  74.7  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  27.04 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 214 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  47.69 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 770 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 204 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  30.27 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 245 aa  62  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 286 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 190 aa  62  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>