More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0281 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  51.81 
 
 		 219 aa  184  8e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 203 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 205 aa  119  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 268 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 189 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 286 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 195 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  34.96 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2681  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.387724  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.78 
 
 		 251 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0144  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 216 aa  62  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1684  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 219 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  49.3 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 332 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 196 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  45.35 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 202 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>