More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4244 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  410  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  60.4 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 438 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  33.09 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0986  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3612  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000248131  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 297 aa  55.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3621  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  38.98 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 332 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.74 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3280  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3301  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00420506  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  44.26 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 497 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3389  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>