More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0167 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  53.68 
 
 		 212 aa  211  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 238 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 221 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  23.39 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  27.89 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3085  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 217 aa  67.8  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  53.12 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 183 aa  65.1  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0349  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3796  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  31.17 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 202 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.97 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
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NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  56.14 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3012  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4681  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 283 aa  62  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 213 aa  62  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 214 aa  62  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 213 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1491  transcriptional regulator, TetR family  38.53 
 
 		 210 aa  61.6  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1600  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0652187  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 207 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
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NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 186 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
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NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3277  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
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NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.04 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
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NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
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CP001637  EcDH1_2536  transcriptional regulator, TetR family  37.61 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.018218  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  40.91 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
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NC_012892  B21_01115  hypothetical protein  37.61 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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