More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0118 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  96.4 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  89.42 
 
 		 222 aa  344  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  79.82 
 
 		 222 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 222 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  88.46 
 
 		 222 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  88.46 
 
 		 222 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  63.13 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4028  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 228 aa  241  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0159  TetR family transcriptional regulator  66.19 
 
 		 232 aa  241  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  43.28 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 199 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  51.72 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 253 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 218 aa  62  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 223 aa  62  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  43.28 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  29.08 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  34.82 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  41.23 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  35 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 271 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 216 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1892  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  40.54 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1928  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 235 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4318  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 214 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  41.1 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 208 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  31.73 
 
 		 230 aa  52.4  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  29.25 
 
 		 240 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 220 aa  52.4  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 225 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>