More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_47520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 211 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.95 
 
 		 234 aa  102  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 211 aa  89.4  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 192 aa  84.7  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 215 aa  64.7  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
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NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  32.59 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  29.19 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  25.45 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  41.77 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 357 aa  62  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
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NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 424 aa  59.7  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  28.41 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
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NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  47.83 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 453 aa  58.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1610  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 424 aa  57.4  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 141 aa  57  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 233 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
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NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
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NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
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NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 233 aa  54.7  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 419 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 225 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
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NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
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NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.03 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.03 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  42.03 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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