More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2556 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 218 aa  99.8  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 204 aa  71.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  23.87 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  46.03 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  35.23 
 
 		 212 aa  62  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  35.14 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  26.59 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  26.9 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  34.31 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3711  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 420 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336995  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  38.89 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  49.09 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 257 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 388 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
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NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  37.5 
 
 		 250 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  31.13 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
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