More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1142 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  420  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 223 aa  150  8e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 204 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  32.83 
 
 		 204 aa  101  6e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 213 aa  84.7  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  26.88 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 188 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 198 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  42.42 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 240 aa  55.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  36.11 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  20.92 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0627  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1913  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000580043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
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NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.98 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0239  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0220692  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011666  Msil_1985  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  48.08 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03760  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.599281  normal  0.484799 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 209 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 231 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 256 aa  51.6  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 230 aa  51.6  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5732  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5353  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5442  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.385516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0891  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.735718  normal  0.888939 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0234  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  27.78 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
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NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
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NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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